آنالیز آماری داده های پروتئومیکس، متابولومیکس و لیپیدومیکس با استفاده از طیف سنجی جرمی ۲۰۱۶
Statistical Analysis of Proteomics, Metabolomics, and Lipidomics Data Using Mass Spectrometry 2016

این کتاب مروری بر طراحی و تحلیل محاسباتی و آماری داده های پروتئومیکس، متابولومیکس و لیپیدومیکس مبتنی بر طیف سنجی جرمی ارائه می دهد. این مجلد گردآوری شده، مقدمه ای بر جنبه های ویژه طراحی و تحلیل آماری با داده های طیف سنجی جرمی برای علوم اومیکس جدید است. متن به جنبه های مشترک طراحی و تحلیل بین و در سراسر همه (یا بیشتر) اشکال طیف سنجی جرمی می پردازد، در حالی که مثال های کاربردی ویژه ای را نیز با رایج ترین اشکال طیف سنجی جرمی ارائه می دهد. همچنین، کاربردهای طیف سنجی جرمی محاسباتی، نه تنها در مطالعات بالینی، بلکه در تفسیر داده های اومیکس در مطالعات زیست شناسی گیاهی نیز پوشش داده می شود.

انتظار می رود حوزه های تحقیقاتی اومیکس با توانایی پروفایل بندی همزمان بسیاری از ترکیبات در خون، ادرار، بافت یا سایر نمونه های بیولوژیکی بیماران، انقلابی در تحقیقات زیست مولکولی ایجاد کنند. طیف سنجی جرمی یکی از تکنیک های تحلیلی کلیدی است که در این علوم اومیکس جدید استفاده می شود. طیف سنجی جرمی کروماتوگرافی مایع، داده های زمان پرواز و طیف سنجی جرمی تبدیل فوریه تنها تعدادی از پلتفرم های اندازه گیری موجود برای تحلیلگر مدرن هستند. بنابراین، در پروتئومیکس یا متابولومیکس عملی، محققان نه تنها با انواع داده های پربعدی جدید روبه رو می شوند—برخلاف ساختارهای داده های آشنا در ژنومیکس کلاسیک تر—بلکه با تنوع زیادی بین انواع متمایز اندازه گیری های طیف جرمی حاصل از پلتفرم های مختلف نیز مواجه خواهند شد که ممکن است تجزیه و تحلیل، مقایسه و تفسیر نتایج را پیچیده کند.

This book presents an overview of computational and statistical design and analysis of mass spectrometry-based proteomics, metabolomics, and lipidomics data. This contributed volume provides an introduction to the special aspects of statistical design and analysis with mass spectrometry data for the new omic sciences. The text discusses common aspects of design and analysis between and across all (or most) forms of mass spectrometry, while also providing special examples of application with the most common forms of mass spectrometry. Also covered are applications of computational mass spectrometry not only in clinical study but also in the interpretation of omics data in plant biology studies.

Omics research fields are expected to revolutionize biomolecular research by the ability to simultaneously profile many compounds within either patient blood, urine, tissue, or other biological samples. Mass spectrometry is one of the key analytical techniques used in these new omic sciences. Liquid chromatography mass spectrometry, time-of-flight data, and Fourier transform mass spectrometry are but a selection of the measurement platforms available to the modern analyst. Thus in practical proteomics or metabolomics, researchers will not only be confronted with new high dimensional data types—as opposed to the familiar data structures in more classical genomics—but also with great variation between distinct types of mass spectral measurements derived from different platforms, which may complicate analyses, comparison, and interpretation of results.