تحلیلِ высокопроизводительный данных ژنومی در حافظه: چگونه فنّاوری پایگاه داده های در حافظه، پزشکی شخصی سازی شده را تسریع می کند ۲۰۱۳
High-Performance In-Memory Genome Data Analysis: How In-Memory Database Technology Accelerates Personalized Medicine 2013

پیشرفت های اخیر در توسعه سخت افزار و نرم افزار، امکان معرفی یک فناوری انقلابی را فراهم کرده است: مدیریت داده در حافظه. این فناوری از تحلیل انعطاف پذیر و فوق العاده سریع مقادیر عظیمی از داده ها، مانند تشخیص ها، درمان ها و داده های ژنوم انسانی پشتیبانی می کند. این کتاب جدیدترین نتایج تحقیقات در مورد کاربرد مدیریت داده در حافظه در پزشکی شخصی سازی شده را به اشتراک می گذارد و آن را از یک امکان محاسباتی به یک واقعیت بالینی تبدیل می کند. نویسندگان جزئیات مربوط به رویکردهای نوآورانه را برای فعال سازی پردازش، ترکیب و تجزیه و تحلیل داده های مرتبط در زمان واقعی ارائه می دهند. این کتاب شکاف بین متخصصان پزشکی، مانند پزشکان، متخصصان بالینی و محققان زیست شناسی، و متخصصان فناوری، مانند توسعه دهندگان نرم افزار، متخصصان پایگاه داده و آمارشناسان را پر می کند. موضوعات مطرح شده در این کتاب شامل – از جمله موارد دیگر – مدل سازی خطوط لوله پردازش و تجزیه و تحلیل داده های ژنوم، پردازش داده های پرتوان، تبادل داده های حساس و حفاظت از مالکیت معنوی است. فراتر از آن، این کتاب بینش هایی را در مورد نمونه های اولیه تحقیقاتی برای تجزیه و تحلیل گروه های بیماران، تجزیه و تحلیل توپولوژی مسیرهای بیولوژیکی و جستجوی ترکیبی در داده های ساختاریافته و بدون ساختار پزشکی به اشتراک می گذارد و فرآیندهای کاملاً جدیدی را که اکنون به دلیل تحلیل های تعاملی داده امکان پذیر شده اند، تشریح می کند.

Recent achievements in hardware and software developments have enabled the introduction of a revolutionary technology: in-memory data management. This technology supports the flexible and extremely fast analysis of massive amounts of data, such as diagnoses, therapies, and human genome data. This book shares the latest research results of applying in-memory data management to personalized medicine, changing it from computational possibility to clinical reality. The authors provide details on innovative approaches to enabling the processing, combination, and analysis of relevant data in real-time. The book bridges the gap between medical experts, such as physicians, clinicians, and biological researchers, and technology experts, such as software developers, database specialists, and statisticians. Topics covered in this book include – amongst others – modeling of genome data processing and analysis pipelines, high-throughput data processing, exchange of sensitive data and protection of intellectual property. Beyond that, it shares insights on research prototypes for the analysis of patient cohorts, topology analysis of biological pathways, and combined search in structured and unstructured medical data, and outlines completely new processes that have now become possible due to interactive data analyses.