کالبدشکافی برهم کنش های تنظیمی آران ای و پروتئین: تلفیق محاسبات و آزمایش های پربازده در زیست شناسی سامانه ها ۲۰۱۴
Dissecting Regulatory Interactions of RNA and Protein: Combining Computation and High-throughput Experiments in Systems Biology 2014

اثری که در این کتاب شرح داده شده، نمونه ای عالی از پژوهش بین رشته ای در زیست شناسی سامانه ها است. این اثر نشان می دهد که چگونه می توان از مفاهیم و رویکردهای حوزه ی فیزیک به طور موثری برای پاسخ به پرسش های زیستی استفاده کرد و گزارش دهنده ی روش شناسی نوینی است که شامل تحلیل های خلاقانه و رایانه محور داده های پرتوان زیستی است. بسیاری از یافته های شرح داده شده در کتاب، که حاصل همکاری بین نویسنده (یک دانشمند نظریه پرداز) و زیست شناسان تجربی و بین آزمایشگاه های مختلف است، در مجلات معتبر با داوری همتا، مانند Molecular Cell و Nature منتشر شده اند. با این حال، در حالی که آن انتشارات به جنبه های مختلف تنظیم ژن پس از رونویسی می پردازند، این کتاب دیدگاهی کامل، منسجم و منطقی از کل پروژه ی پژوهشی را در اختیار خوانندگان قرار می دهد. مقدمه، تنظیم ژن پس از رونویسی را از زاویه ای متمایز ارائه می کند و جنبه هایی از نظریه ی اطلاعات و تکامل را برجسته می سازد و زمینه ساز سوالاتی است که در فصل های بعدی به آن ها پرداخته می شود؛ فصل هایی که به تنظیم ترانسکریپتوم به عنوان حامل اصلی عملکردی اطلاعات ژنتیکی فعال می پردازند.

The work described in this book is an excellent example of interdisciplinary research in systems biology. It shows how concepts and approaches from the field of physics can be efficiently used to answer biological questions and reports on a novel methodology involving creative computer-based analyses of high-throughput biological data. Many of the findings described in the book, which are the result of collaborations between the author (a theoretical scientist) and experimental biologists and between different laboratories, have been published in high-quality peer-reviewed journals such as Molecular Cell and Nature. However, while those publications address different aspects of post-transcriptional gene regulation, this book provides readers with a complete, coherent and logical view of the research project as a whole. The introduction presents post-transcriptional gene regulation from a distinct angle, highlighting aspects of information theory and evolution and laying the groundwork for the questions addressed in the subsequent chapters, which concern the regulation of the transcriptome as the primary functional carrier of active genetic information.