بیوانفورماتیک: راهنمای عملی پایگاه‌های داده NCBI و هم ردیفی توالی‌ها ۲۰۲۲
Bioinformatics 2022

**بیوانفورماتیک: راهنمای کاربردی پایگاه‌های داده NCBI و همترازی توالی‌ها** مبانی بیوانفورماتیک و پوشش جامعی از پایگاه‌های داده NCBI، همترازی توالی‌ها و ابزار جستجوی همترازی محلی توالی NCBI (BLAST) را ارائه می‌دهد. از آنجایی که بیوانفورماتیک برای علوم زیستی ضروری شده است، این کتاب به طور خاص برای رفع نیازهای مخاطبان گسترده‌ای از جمله دانشجویان مقطع کارشناسی، فارغ‌التحصیلان، محققان، متخصصان مراقبت‌های بهداشتی و اساتید بیوانفورماتیک که نیاز به استفاده از پایگاه‌های داده NCBI، بازیابی داده‌ها از آن‌ها و استفاده از BLAST برای یافتن توالی‌های مرتبط از نظر تکاملی، حاشیه‌نویسی توالی، ساخت درخت تبارزایی و حوزه حفاظت‌شده یک پروتئین دارند، نوشته شده است. جزئیات فنی الگوریتم‌های همترازی با حداقل استفاده از فرمول‌های ریاضی و با تصاویر گرافیکی توضیح داده شده‌اند.

ویژگی‌های کلیدی:

* آشنایی خوانندگان با پرکاربردترین دانش بیوانفورماتیک از پایگاه‌های داده و همترازی‌ها، شامل هم نظریه و هم کاربرد از طریق تصاویر و مثال‌های حل‌شده.
* بحث در مورد استفاده از خط فرمان ویندوز، شل لینوکس، R و پایتون هم برای پایگاه‌های داده Entrez و هم BLAST.
* وب‌سایت همراه (http://www.hamiddi.com/instructors/) شامل آموزش‌ها، کدهای R و پایتون، مطالب آموزشی از جمله اسلایدها، تمرین‌ها و مسائل برای دانشجویان است.

این کتاب درسی ایده‌آل برای دوره‌های بیوانفورماتیک است که توسط دانشجویان علوم زیستی گذرانده می‌شود و برای محققانی که مایل به توسعه دانش خود از بیوانفورماتیک برای تسهیل تحقیقات خود هستند، مناسب است.

Bioinformatics: A Practical Guide to NCBI Databases and Sequence Alignments provides the basics of bioinformatics and in-depth coverage of NCBI databases, sequence alignment, and NCBI Sequence Local Alignment Search Tool (BLAST). As bioinformatics has become essential for life sciences, the book has been written specifically to address the need of a large audience including undergraduates, graduates, researchers, healthcare professionals, and bioinformatics professors who need to use the NCBI databases, retrieve data from them, and use BLAST to find evolutionarily related sequences, sequence annotation, construction of phylogenetic tree, and the conservative domain of a protein, to name just a few. Technical details of alignment algorithms are explained with a minimum use of mathematical formulas and with graphical illustrations.

Key Features

• Provides readers with the most-used bioinformatics knowledge of bioinformatics databases and alignments including both theory and application via illustrations and worked examples.
• Discusses the use of Windows Command Prompt, Linux shell, R, and Python for both Entrez databases and BLAST.
• The companion website (http://www.hamiddi.com/instructors/) contains tutorials, R and Python codes, instructor materials including slides, exercises, and problems for students.

This is the ideal textbook for bioinformatics courses taken by students of life sciences and for researchers wishing to develop their knowledge of bioinformatics to facilitate their own research.