بیوانفورماتیک برای ایمونومیکس ۲۰۰۹
Bioinformatics for Immunomics 2009

مانند بسیاری از واژگان، اصطلاح “ایمونومیکس” بسته به متن، مفاهیم متفاوتی را در بر می گیرد. در بازه ای کوتاه، ایمونومیکس به معنای مطالعه ایمونوم بود که خود تعاریف گوناگونی داشت. یک معنای که اکنون تا حد زیادی منسوخ شده است، ایمونوم را مجموعه ای از پپتیدهای آنتی ژنی یا پروتئین های ایمنی زای درون یک میکروارگانیسم منفرد – چه ویروس، باکتری، قارچ یا انگل – یا جمعیت میکروبی، یا پروتئین ها و پپتیدهای آنتی ژنی یا آلرژی زای مشتق شده از محیط به طور کلی، شامل پروتئین هایی از منابع یوکاریوتی، تلقی می کرد. با این حال، زمانه تغییر کرده و معنای ایمونومیکس نیز متحول شده است. تعاریف جدیدتر دیگری از ایمونوم پدید آمده اند که بر انبوه گیرنده های ایمونولوژیکی و مولکول های کمکی تشکیل دهنده زرادخانه ایمنی میزبان تمرکز دارند. امروزه، ایمونومیکس یا ایمونوژنومیکس بیشتر به عنوان مترادفی برای ایمونولوژی مبتنی بر ژنوم با توان عملیاتی بالا به کار می رود. این مطالعه جنبه هایی از سیستم ایمنی با استفاده از تکنیک های پربازده در یک چشم انداز مفهومی است که هم از تفکر بالینی و هم بیوفیزیکی نشات می گیرد.

Like many words, the term “immunomics” equates to different ideas contingent on context. For a brief span, immunomics meant the study of the Immunome, of which there were, in turn, several different definitions. A now largely defunct meaning rendered the Immunome as the set of antigenic peptides or immunogenic proteins within a single microorganism – be that virus, bacteria, fungus, or parasite – or microbial population, or antigenic or allergenic proteins and peptides derived from the environment as a whole, containing also proteins from eukaryotic sources. However, times have changed and the meaning of immunomics has also changed. Other newer definitions of the Immunome have come to focus on the plethora of immunological receptors and accessory molecules that comprise the host immune arsenal. Today, Immunomics or immunogenomics is now most often used as a synonym for high-throughput genome-based immunology. This is the study of aspects of the immune system using high-throughput techniques within a conc- tual landscape borne of both clinical and biophysical thinking.