این کتاب دسترسی آزاد، مقدمه ای گام به گام است که چگونه اسکریپت نویسی پوسته می تواند به حل بسیاری از وظایف پردازش داده ای که متخصصان Health و Life هر روز با حداقل وابستگی به نرم افزار با آن مواجه می شوند، کمک کند. مثالهای ارائهشده در کتاب نشان میدهند که چگونه میتوان از ابزارها و ترکیبهای خط فرمان ساده برای بازیابی دادهها و متن از منابع وب، فیلتر کردن و استخراج ادبیات، و کشف معناشناسی رمزی در هستیشناسی زیستپزشکی استفاده کرد. برای ذخیره دادهها، این کتاب بر قالبهای استاندارد فایل متنی باز مانند TSV، CSV، XML، و OWL تکیه دارد که میتواند توسط هر ویرایشگر متن یا برنامه صفحهگسترده باز شود.
دو فصل اول، مقدمه و منابع، مقدمه کوتاهی بر اسکریپت نویسی پوسته و توصیف منابع داده رایج در علوم بهداشتی و زیستی را ارائه می دهد. فصل سوم، بازیابی داده ها، با معرفی یک وظیفه پردازش داده رایج شامل منابع داده های متعدد آغاز می شود. سپس، این فصل نحوه خودکارسازی هر مرحله از این کار را با معرفی ابزارهای خط فرمان مورد نیاز یک به یک توضیح می دهد. فصل 4، پردازش متن، نحوه فیلتر کردن و تجزیه متن را با استفاده از تکنیک های تطبیق رشته ها و عبارات منظم نشان می دهد. فصل آخر، پردازش معنایی، نشان می دهد که چگونه پرس و جوهای XPath و اسکریپت نویسی پوسته قادر به پردازش داده های پیچیده، مانند نمودارهای مورد استفاده برای تعریف هستی شناسی هستند.
علاوه بر اینکه برای اطلاعات بیشتر از چهار دهه پیش تقریباً تغییرناپذیر بوده و در اکثر رایانههای شخصی ما در دسترس است، یادگیری اسکریپت توسط متخصصان سلامت و زندگی نسبتاً آسان است. یک سری دستورات مستقل درک آن مانند اجرای یک پروتکل آزمایشگاهی جدید با آزمایش و درک مراحل و متغیرهای رویه ای آن و ترکیب نتایج میانی آنهاست. بنابراین، این کتاب به ویژه برای متخصصان سلامت و زندگی یا دانشآموزانی که میخواهند یاد بگیرند که چگونه دادهها و متن را به راحتی پردازش کنند، مرتبط است، که به نوبه خود ممکن است آنها را برای کسب مهارتهای بیوانفورماتیک عمیقتر در آینده تسهیل و الهام بخشد.